MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16L

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021520	AAC	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
2	NC_021520	ACA	3	9	284	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
3	NC_021520	AC	3	6	336	341	50 %	0 %	0 %	50 %	513844558
4	NC_021520	TTA	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844558
5	NC_021520	CAA	2	6	508	513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
6	NC_021520	GTT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844558
7	NC_021520	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844558
8	NC_021520	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
9	NC_021520	T	6	6	3118	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
10	NC_021520	A	7	7	3143	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
11	NC_021520	TTA	3	9	3157	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
12	NC_021520	TTTC	2	8	3176	3183	0 %	75 %	0 %	25 %	513844559
13	NC_021520	TCAACA	2	12	3218	3229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	513844559
14	NC_021520	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
15	NC_021520	T	6	6	3319	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
16	NC_021520	TG	4	8	3407	3414	0 %	50 %	50 %	0 %	513844559
17	NC_021520	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
18	NC_021520	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
19	NC_021520	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
20	NC_021520	GTAT	2	8	3559	3566	25 %	50 %	25 %	0 %	513844559
21	NC_021520	ATGG	2	8	3589	3596	25 %	25 %	50 %	0 %	513844559
22	NC_021520	TG	3	6	3655	3660	0 %	50 %	50 %	0 %	513844559
23	NC_021520	T	6	6	3673	3678	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
24	NC_021520	A	6	6	3696	3701	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
25	NC_021520	TTC	2	6	3703	3708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844559
26	NC_021520	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	513844559
27	NC_021520	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
28	NC_021520	TCA	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
29	NC_021520	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
30	NC_021520	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
31	NC_021520	GAATTA	2	12	3943	3954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	513844559
32	NC_021520	TA	3	6	3980	3985	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
33	NC_021520	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
34	NC_021520	TA	4	8	4146	4153	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
35	NC_021520	AT	3	6	4197	4202	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
36	NC_021520	TTAT	2	8	4227	4234	25 %	75 %	0 %	0 %	513844559
37	NC_021520	T	6	6	4249	4254	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
38	NC_021520	GAC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844559
39	NC_021520	TAG	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844559
40	NC_021520	ATT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
41	NC_021520	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
42	NC_021520	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
43	NC_021520	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
44	NC_021520	T	7	7	4686	4692	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
45	NC_021520	AAC	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
46	NC_021520	AAT	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
47	NC_021520	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844560
48	NC_021520	TCT	2	6	5733	5738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
49	NC_021520	TTC	2	6	5741	5746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
50	NC_021520	TCA	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
51	NC_021520	TAA	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
52	NC_021520	ACT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
53	NC_021520	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844560
54	NC_021520	AT	3	6	6010	6015	50 %	50 %	0 %	0 %	513844560
55	NC_021520	TTGG	2	8	6119	6126	0 %	50 %	50 %	0 %	513844561
56	NC_021520	T	6	6	6131	6136	0 %	100 %	0 %	0 %	513844561
57	NC_021520	ATC	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844561
58	NC_021520	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844561
59	NC_021520	TAA	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
60	NC_021520	AGC	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844561
61	NC_021520	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
62	NC_021520	ATT	3	9	6304	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.